총장
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- 교수회
- 대학평의원회
- 교무위원회
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- 융합과학기술원
- 고등과학원
- 고등교육혁신원
- 윤리인권위원회
- 글로벌사회공헌원
- 총장실
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- 교학부총장
- 행정•대외부총장
- 의무부총장
- 미래캠퍼스부총장
- 국제캠퍼스부총장
- 연구본부장
하위기관
심의기구
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위원장: 총장
- 국제캠퍼스 추진위원회
- 비전실행위원회
- 건축기획위원회
- 대학원위원회
- 용재상 운영위원회
- 시설공사 발주심의위원회
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위원장: 교학부총장
- 규정심의위원회
- 기념물건립심의위원회
- 교원인사위원회
- 기금교수관리위원회
- 교원포상심의위원회
- 특훈교수 후보추천위원회
- 교원양성위원회/교직부
- 장애학생 교육위원회
- 성폭력대책위원회
- 연구윤리진실성위원회
- 국제관계총괄위원회
- 국가고시관리위원회
- 연구기구심의위원회
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위원장: 행정대외부총장
- 사회복지문화사업 운영 위원회
- 행정효율화 추진위원회
- 공간위원회
- 의식위원회
- 에너지관리위원회
- 환경안전관리위원회
- 등록제도 운영위원회
- 자금운용위원회
- 구매관리위원회
- 정보화위원회
본부행정기관
- 교목실 기획실 교무처 입학처
- 학생복지처 연구처 총무처 시설처
- 학술정보원 대외협력처 국제처 백양로 건설사업본부
대학
대학원
- 대학원 연합신학대학원 경영전문대학원 국제학대학원 정보대학원 커뮤니케이션대학원 사회복지대학원
- 법학전문대학원 의학전문대학원 치의학전문대학원 행정대학원 공학대학원 보건대학원(의료원) 보건환경대학원(원주)
- 정경·창업대학원(원주) 언론홍보대학원 법무대학원 생활환경대학원 경제대학원 간호대학원(의료원)
대학교부설연구원
- 국학연구원 동서문제연구원 언어정보연구원 준결정재료연구단 프로테옴연구원 대사조절유전체통합연구센터 국가관리연구원 구강악안면경조직연구센터 의료법윤리학연구원 친환경건축연구센터 인문학연구원 공학교육혁신센터 패턴집적형능동폴리머소재센터 신경과학기술융합연구단 법학연구원 국방피탐지감소기술특화연구센터 변형제어고성능전자소자연구단 단분자 시스템 생물학 연구단
- 단백질기능제어이행연구센터 생체방어연구센터 빈곤문제국제개발연구원 세브란스병원뇌심혈관질환융합연구사업단 간경변증임상연구센터 U-City융합서비스연구개발단 융합신약연구센터 생기능성유기분자연구단 진화나노연구단 무한내마모연구단 심혈관질환제품유효성평가센터 이승만연구원 글로벌융합기술연구원 차세대DTV방송기술연구센터 은하진화연구센터 인체에너지변환융합파이오니어연구단 세포사멸연구단
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대학간연구소
- 교육연구소 공공문제연구소 근대한국학연구소 인지과학연구소
- 미디어아트연구소 지식정보화연구소 개인식별연구소 나노과학기술연구소
- 젠더연구소 방송통신정책연구소
부속기관
- 대학교회 박물관 건강센터 대학언론사 대학출판문화원 체육위원회
- 천문대 공학원 사회복지센터 청년문화원 김대중도서관 종합서비스센터
- 생활관 방사선안전관리센터 실험동물연구센터 삼애교회 창업지원단
부속교육기관
- 언어연구교육원
- 어린이생활지도연구원
- 미래교육원
대학·대학원 소속 부속기관
- 경영대학원 부속 상남경영원 생활과학대학 부속 알렌관
- 연합신학대학원 부속 상담·코칭지원센터 교육과학대학 부속 생활체육지도자연수원
- 사회복지대학원 부속 자원봉사센터 영상대학원 부속 영상제작센터
기타기관
- 과학영재교육원
- 직장예비군연대
- 학생군사교육단